Kerjasama yang dilakukan STMIK Muhammadiyah Jakarta dengan berbagai pihak:

• Kerjasama dengan pemerintah:  Direktorat Jenderal Pendidikan Agama Islam (Kementerian Agama RI) tahun 2019 dalam pengembangan Pembalajaran PAI SMK Berbasis ICT di Bogor
• Kerjasama dengan dunia industri dan jasa, seperti: PT. Kreasi Pranata Terpadu, PT. Bank Tabungan Negara, PT. Teknologi Sukses Maya
• Kerjasama dengan non pemerintah: Kerjasama dengan Cabang Muhammadiyah Tanah Abang 1 dalam kesempatan akses beasiswa pendidikan tinggi